Esta especie difiere de P. obmutescens por tener el dorso café a gris (café oscuro enP. obmutescens); de P. orcesi por tener el dorso levemente granular (areolado en P. orcesi); de P. racemus por tener una línea cantal (ausente en P. racemus); de P. simoteriscus por tener hendiduras vocales (ausentes en P. simoteriscus) y por tener el vientre mayoritariamente crema (café pálido en P. simoteriscus); de P. simoterus por tener los discos de los dedos de las manos relativamente grandes (relativamente pequeños en P. simoterus) y por no tener tubérculos e el dorso (presentes en P. simoterus); de P. thymelensis por no tener crestas paravertebrales (presentes en P. thymelensis) y de P. hucundo por no tener usualmente tubérculos tarsales (presentes en P. huicundo). Los machos de P. ortizi tienen flancos areolados (levemente granulares a tuberculados en P. huicundo) y tubérculos pequeños o no evidentes en el párpado, ulna y talón (tubérculos pronunciados en los machos de P. huicundo) (Guayasamin et al. 2004).

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(1) Piel dorsal levemente granular; flancos de hembras con numerosos tubérculos aplanados, en machos areolados; vientre areolado, pliegues dorsolaterales ausentes; (2) anillo timpánico evidente, redondo, 23.1-46.4 % del tamaño del ojo, membrana timpánica poco definida; (3) distancia ojo narina 59.4-81.5 % del tamaño del ojo; hocico redondeado visto dorsalmente sin papilas en la punta; (4) párpado superior mas angosto que el espacio interorbital, con o sin un tubérculo pequeño; crestas craneales ausentes; (5) dientes vomerinos ausentes o reducidos y difíciles de ver; (6) machos con hendiduras vocales y saco vocal subgular medio; almohadillas nupciales ausentes; (7) Dedo I de la mano más corto que el II, dedos con discos expandidos; (8) dedos de las manos con rebordes laterales carnosos; (9) tubérculos ulnares usualmente ausentes, si presentes pequeños; tarso sin tubérculos en el borde externo; (11) dos tubérculos metatarsales prominentes, el interno oval, dos a tres veces el tamaño de los tubérculos subcónicos externos; tubérculos plantares supernumerarios usualmente bajos y difíciles de ver; (12) dedos de los pies con rebordes laterales carnosos; (13) en etanol, dorso usualmente gris uniforme a café; líneas cantales e interorbitales gris a café; línea blanca en el borde externo del párpado y cantus rostralis; Barras labiales y barras en las piernas usualmente ausentes; región gular crema blancuzco; vientre uniforme crema blancuzco a crema con reticulaciones gris oscuro; ingle y superficie posterior de los muslos usualmente crema blancuzco; superficies palmar y plantar crema blancuzco (Guayasamin et al. 2004).

Existe variación entre individuos (Guayasamin et al. 2004): QCAZ 14765: Iris cobre café; dorso café pálido con espéculos dorados; piernas y brazos café con barras verde pálido; ingle café oscuro con parches verde brillante; región gular café verdoso; vientre blanco con espéculos café oscuro. QCAZ 14777: Dorso café uniforme; líneas cantales y supraorbitales blanco grisáceo; flancos café con puntos blancos delineados de negro. QCAZ 14789: Dorso uniformemente amarillo verdoso. QCAZ 14783: Dorso amarillo con marcas café oscuro; flancos amarillos.