Esta especie se puede confundir con los miembros del grupo frater, P. walkeri y miembros del grupo diastema. Difiere de todos ellos, excepto las especies del grupo diastema, por tener las cubiertas de los discos expandidas y espadadas en algunos dígitos y la mayoría de los dedos de los pies. DENTRO DEL GRUPO DIASTEMA LA NUEVA ESPECIE PUEDE DISTINGUIRSE DE P. ANTHRAX, P. diastema, P. hylaeformis, P. quidditus, P. tigrillo, P. tinker y P. vocator por tener el tubérculo palmar bífido y por no tener pliegues gulares. P. esmeraldas difiere de P. chalceus, P. quidditus y P. tinker por no tener papilas en las cubiertas de los discos de todos los dedos de las manos y pies. P. esmeraldas difiere de P. scolodiscus por tener odontóforos vomerinos evidentes (ausentes o poco evidentes en P. scolodiscus) y e dorso café con marcas oscuras en preservante (crema con finos puntos negros en P. scolodiscus) P esmeraldas se diferencia de P. tigrillo por no tener pústulas dorsales y por tener el dorso café con una marca escapular café oscuro en forma de W y un chevron sacral en el cuerpo (dorso amarillo pálido con puntos café y muchas puntuaciones diminutas entre los puntos en P. tigrillo)

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(1) Piel dorsal levemente granular, flancos levemente granulados con algunos tubérculos grandes en la mayoría de machos y hembras, vientre finamente areolado; sin pliegues discoidal, gular o dorsolateral; (2) anillo timpánico presente, membrana timpánica no evidente; (3) distancia ojo-narina 65.5-86.7% del diámetro del ojo; hocico redondeado visto dorsal y lateralmente; (4) párpado superior más angosto que la distancia interorbital, con tubérculos bajos; crestas craneales ausentes; (5) proceso dentígero vomerino prominente, oblicuo, posteriomedialmente a la coana con 2-5 dientes; (6) machos adultos con hendiduras vocales, sin almohadillas nupciales; saco vocal medio, subgular; (7) Dedo I más corto que el II, cubiertas de los discos redondas en Dedo I y II de la mano, cubiertas de los discos en Dedo III y IV expandidos y espadados; un solo tubérculo subarticular distal; tubérculo palmar bífido; tubérculos palmares supernumerarios no evidentes; (8) dedos de la mano cortos con rebordes laterales angostos; (9) tubérculos ulnares ausentes; (10) talón sin tubérculos, tubérculos tarsales ausentes; (11) dos tubérculos tarsales prominentes, el interno oval, 1.5-2.25 veces el tamaño del externo que es redondo; tubérculos plantares supernumerarios poco evidentes; (12) dedos de los pies sin rebordes laterales angostos, membrana ausente; la mayoría de los dedos de los pies (usualmente II-IV) con cubiertas de los discos expandidas, un tubérculo subarticular distal; Dedo V del pie más largo que el III; (13) en etanol la mayoría de los especímenes tienen el dorso café y una marca escapular café oscuro en forma de W, chevron sacral y una barra lumbar; piernas con barras transversales; barras desteñidas en los labios, línea cantal ausente; ingle café con puntos blancos, vientre café con flecos crema.

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